農業產業化部主要職能是推動公司大棉商戰略布局，積極配合推動與兵團、供銷社戰略合作；配合棉花事業部進行棉花產業政策研究，調研“公司+農戶”關鍵模式，主要包括訂單農業和“公司+農戶”關鍵模式探討與設計。